产品简介: DNase I , 即 Deoxyribonuclease I , 即脱氧核糖核酸酶 I , 是一种可以消化单链或双链 DNA 产生单脱氧核苷酸或单链或双链的寡脱氧核苷酸的核酸内切酶。DNase I 水解单链或双 链 DNA 后的产物, 5'端为磷酸基团,3'端为羟基。 DNase I 活性依赖于钙离子, 并能被镁离子或二价锰离子激活 。镁离子存在条件下, DNase I 可随机剪切双链 DNA 的任意位点;二价锰离子存在条件下,DNase I 可在同一位点 剪切 DNA 双链,形成平末端, 或 1 -2 个核苷酸突出的粘末端。 特点:不含 RNase (RNase free), 可以用于各种 RNA 样品的处理 。提供了用于 DNase I 失活所需的 EDTA。 用途:制备不含 DNA 的 RNA 样品;RT -PCR 反应前 RNA 样品中去除基因组 DNA 等可 能的 DNA 污染;体外 T7, T3, SP6 等 RNA Polymerases 催化的 RNA 转录后去除 DNA 模板; DNase I footprinting 研究 DNA -蛋白质相互作用; 缺口平移(nicktranslatioin); 产生 DNA 随 机片段文库; 细胞凋亡 TUNEL 检测中部分剪切基因组 DNA 作为阳性对照。 来源:从牛胰腺纯化得到 。分子量: 约 32kDa(单体)。 活性定义:37°C 10 分钟内,将能够降解 1 μg pBR322 质粒 DNA 所需的酶量定义为 1 个活性单位。 活性检测条件:40mM Tris -HCl (pH8.0) , 10mM MgSO4, 1mM CaCl2 , 1 μg of pBR322 DNA 。纯度:不含其它 DNA 内切酶和外切酶,不含 RNA 酶。 保存条件: -20°C 保存, 一年内有效。 操作流程: 1 RT -PCR 反应前 RNA 样品中 DNA 的去除: 1.1 DNA 模板限制性核酸内切酶作用后线性化。酚/氯仿和氯仿/异丙醇提取 DNA,用乙醇沉 淀后, 溶于适量的无菌去离子水中。 1.2 向一无 RNA 酶的 EP 管中依次加入下列试剂:
补充经 DEPC 处理的去离子水 | 至 9 μl | DNase I (1U/μl) | 1 μl |
注意:如需处理较大量的 RNA 样品, 可以按照比例放大上述反应体系 。如果能在上述反应 体系中加入适量 Ribonuclease inhibitor 以防止 RNA 降解则更佳。 1.3 37°C 孵育 30min。 1.4 向上述反应体系中加入 1 μl 25mM EDTA,65°C 孵育 10min, 以失活 DNase I 。注意:在 没有鏊合剂如 EDTA 等存在情况下加热, RNA 可被水解。 1.5 上述加热处理过的 RNA 样品即可直接用于处理好的 RNA 可用作 RT -PCR 反应的模板。 2 体外 RNA 反转录后模板 DNA 的去除: 2.1 在每含有 0.5 μg 模板 DNA 的反转录反应体系中加入 1U DNase I 。注意:在某些情况下, 模板 DNA消化所需的 DNase I 的量需通过实验进行摸索。 2.2 37°C 孵育 15min。 2.3 酚/氯仿抽提失活 DNase I。 3 缺口平移进行 DNA 标记 3.1 参考如下表格设置反应: Reaction Buffer (10×) for DNA Polymerase I | 2.5 μl | 3 dNTP Mixture (1mM each, without the labeled dNTP) * | 1.25μl | [α -32P]-dNTP, ~110TBq/mmol (3000Ci/mmol) | 1.85 -3.7MBq (50 -100μ Ci) | DNase I (freshly diluted to 0.002U/μl)** | 1 μl | DNA Polymerase I, E.coli | 0. 5 -1.5 μl (5 -15U) | Template DNA | 0.25μg | 补充无核酸酶去离子水 | 至 25μl |
* 3 dNTP Mixture (1mM each, without the labeled dNTP):分别取除已经标记的 dNTP 外的 3 种 dNTP(100mM) 各 1 μl 加入到 97μl 的无核酸酶的去离子水中混匀即可 。例如标记的为 dATP,则需混合 dTTP、dCTP 和 dGTP 三种 dNTP 至每种的最终浓度为 1mM。配制好的 dNTP 可存放于 -20°C 以备后续使用。 ** DNase I 可以用 1 × Reaction Buffer for DNA Polymerase I 进行稀释。 Reaction Buffer (10 ×) for DNA Polymerase I : 500mM Tris -HCl (pH7.5 at 25°C) , 100mM MgCl2 , 10mM DTT。 3.2 立即 15°C 孵育 15~60min。 3.3 上述反应体系中加入 1μl 0.5M EDTA(pH 8.0)终止反应。 3.4 从中取出少量例如 1 μl 检测标记效率 。通常标记效率至少可以达到 108cpm/μg DNA。 3.5 可用 Sephadex G -50 或 Bio -Gel P -60 去除[α -32P]-dNTP, 以纯化获得标记的 DNA。 温馨提示: 为了您的自身安全,使用试剂前,请做好防护,如穿实验服, 带手套等。
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