脂质组概念 脂质学(Lipidomics)的概念是随着基因组,蛋白质组研究的兴起而被提出的,早由华人科学家韩贤林在2003提出。脂质组学是对生物体、组织或细胞中的脂质以及与其相互作用的分子进行全面系统的分析、鉴定,了解脂质的结构和功能,进而揭示脂质代谢与细胞、器官乃至机体的生理、病理过程之间的关系的一门学科。 脂质分子 脂质是自然界中存在的一大类不溶于水而易溶解于有机溶剂、在化学成分及结构上非均一的化合物,主要包括脂肪酸及其天然发生的衍生物(如酯或胺),以及与其生物合成和功能相关的化合物。脂质能够参与多种生物代谢:能量转换、物质运输、信息识别与传递、细胞发育和分化及细胞凋亡等。脂质代谢异常可引发诸多人类疾病,包括糖尿病、肥胖症、癌症以及神经退行性疾病等。目前,脂质组学已经被广泛运用于药物研发、分子生理学、分子病理学、功能基因组学、营养学以及环境与健康等重要领域研究。 研究表明哺乳动物体内约存在1000-2000种脂质,并且随着脂质研究技术的不断发展,各种新的脂质分子还在不断地被发现。由于脂质种类繁多,美国国立卫生研究院(NIH)提出将脂质主要分为以下八类: 脂质组学研究方法概述 1. 脂肪酸类fatty acyls 2. 甘油脂类glycerolipds 3. 甘油磷脂类glycerophospholipids 4. 鞘脂类sphingolipdis 5. 固醇脂类sterol lipids 6. 孕烯醇酮脂类prenolipids 7. 糖脂类saccharolipids 8. 多聚乙烯类polyketides 脂质组学研究方法概述 常见脂质在细胞中的分布 脂质组学研究方法概述 脂质组研究heatmap图 脂质组学鉴定方法 脂质代谢物结构较为复杂,按极性可分为极性脂类(如甘油磷脂、鞘脂)和非极性脂类(如甘油酯、胆固醇)。根据不同的官能团、碳链长度、双键数量等差异,不同的脂质也可在色谱上被分离。 以下是几种常用脂质鉴定的技术方法: 一 “法”(shotgun method) 基于电喷雾离子化质谱ESI-MS的“法”(shotgun method) 是目前研究脂质组学常用的分析方法。脂质样品在提纯后,不经色谱柱分离,直接进样后根据脂质分子不同pH值条件下电荷差异性进行离子源内分离。正、负离子模式下分开检测不同脂质分子。法具有样品前处理简单、样品用量少、分析时间短等特点。缺点是较难分析低丰度脂质。 脂质组学研究方法概述 “法”脂质组分析实验流程 二 气相色谱与质谱联用(GC-MS) 脂类小分子大多具有较高的挥发性,气相色谱能够快速有效地将脂质与其他大分子物质分离,再通过质谱鉴定脂类小分子。但对分析物挥发性、衍生化的要求制约了GC-MS在脂质组学中的应用。 三 液相色谱与质谱联用(LC-MS) 相比气相色谱,液相色谱对分析物没有挥发性要求,亦无需进行衍生化,可在保留脂质完整信息的前提下实现色谱柱上的良好分离,广泛适用于脂质组学研究,根据液相色谱流动相和色谱柱类型的不同,可分为正相色谱(NPLC)和反相色谱(RPLC)2种分离模式。 NPLC根据特征官能团实现脂质类间分离,但由于NPLC多采用等疏水溶性流动相,因此不易溶解极性脂质,对质谱兼容性差,脂质定量结果重现性也较低。 RPLC根据脂质不饱和度及碳链长度实现脂质类内分离,但不利于脂质类间分离,由于流动相中水相比例较高,非极性脂质溶解性不佳,且强极性、水溶性脂质保留时间过短、分离度较低而信号堆积不利于检测。 四 亲水作用色谱-质谱联用技术(HILIC-MS) 亲水作用色谱(hydrophilic interaction liquid chromatography,HILIC)是一种新型色谱分离模式,其分离机制介于NPLC和RPLC之间,整合了RPLC和NPLC的优缺点。HILIC采用未键合硅胶极性固定相和水-水溶性有机溶剂为流动相,有利于极性脂质的分离,克服了NPLC和RPLC在极性脂质分离过程中的不足,使脂质在类间分离的基础上进一步实现类内分离。由于流动相含有高浓度有机相,可增强脂质离子化效率,提高脂质检测灵敏度,与质谱有较好的兼容性。 脂质组学研究方法概述 HILIC,NPLC和RPLC几种色谱的特性比较 脂质组学研究方法概述 百泰派克生物科技依托高通量气相,液相色谱串联Obitrap Fusion Lumos质谱分析平台,专业统计学和生物信息学分析技术,以及经验丰富的脂质组分析专家团队,配合各类脂肪酸同位素标准品,能够对超过40 个脂肪酸进行精准定性、定量分析。关于脂质分子(组)详细实验方案和样品要求, |