三、技术优势: 1、高通量,低成本:一次测序可得到数百万条序列,单次运行可经济分析多个样品; 2、高分辨率:基于高通量测序技术能够直接从单核苷酸水平研究小分子RNA,不存在传统芯片杂交的荧光模拟信号带来的交叉和背景噪音问题,非常有利于区分相同家族以及序列极为相似的不同sRNA; 3、高精准度:reads能覆盖sRNA全序列,可成功检测低丰度表达的miRNA; 4、通用平台,不依赖已知信息:可进行任何物种的sRNA序列测定,既能鉴定已知的miRNA,又能预测新的miRNA; 5、可重复性高:深度测序保证了抽样随机性,重复性非常好,无需重复实验 四、样本要求: 1、样品类型:完整且无污染的总RNA; 2、样品需求量(单次):≥10 μg; 3、样品浓度:≥200 ng/μL; 4、样品纯度:OD260/280 =1.8~2.2;OD260/230≥2.0;28S:18S≥1.5;RIN≥8.0;23S:16S≥1.5 (此项要求只针对原核生物)。 五、成功案例: 【案例一】:采用新一代测序技术分析浸水24小时后的玉米种子的小RNA文库,进一步分析确认了115个已知miRNA属于24个miRNA家族,并发现了167个新的玉米miRNA。使用同样的方法,再次建立小RNA文库,将获得的已知miRNA和新发现miRNA的信息与重新构建的小RNA文库进行比对,成功推测出106个新miRNA的候选靶标。研究结果显示:玉米浸水种子中存在着miRNA媒介的基因表达调控。 |