概念编辑 mRNA:即messenger RNA 信使RNA是由DNA经由转录而来,带着相应的遗传讯息,为下一步转译成蛋白质提供所需的讯息。在细胞中,mRNA从合成到被降解,经过了数个步骤。在转录的过程中,第二型RNA聚合酶从DNA中复制出一段遗传讯息到mRNA前体pre-mRNA上。在原核生物中,除了5'加帽之外mRNA并未被进一步处理而经常是边转录边转译。在真核生物中,转录跟转译发生在细胞的不同位置,转录发生在储存DNA的细胞核中,而转译是发生在细胞质中。 转录组学(transcriptomics)是在基因组学后新兴的一门学科,即研究特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA(包括mRNA和非编码RNA)的类型与拷贝数。Illumina提供的mRNA测序技术可在整个mRNA领域进行各种相关研究和新的发现。mRNA测序不对引物或探针进行设计,可自由提供关于转录的客观和信息。研究人员仅需要一次试验即可快速生成完整的poly-A尾的RNA完整序列信息,并分析基因表达、cSNP、全新的转录、全新异构体、剪接位点、等位基因特异性表达和罕见转录等全面的转录组信息。简单的样品制备和数据分析软件支持在所有物种中的mRNA测序研究。 [1] 测序流程编辑 1)样本准备(3days) 图1所示。 [2] 2)上机测序1X40(single run,50h),2X80(PE,180h),2X100(PE,220h),2X120(PE,260h),2X150(PE,320h) 3)图像识别,Basecalling,过滤接头序列,检测可能的样品污染。 |